چارٹر اسکولوں میں NYC کمیونٹی اسکولوں سے مختلف قوانین اور احتسابی ڈھانچے ہوتے ہیں، لیکن انہیں طلباء اور والدین کے بعض حقوق کو برقرار رکھنا ہوتا ہے۔ اس میں معذور طلباء اور انگلش لینگویج لرنرز (ELLs) کے حقوق کو برقرار رکھنا اور نظم و ضبط کی پالیسی کے بعض ضوابط پر عمل کرنا شامل ہے۔

AFC کا چارٹر سکولز انیشیٹو ان طلباء کے کم آمدنی والے والدین کو مشورہ، قانونی نمائندگی اور تربیت فراہم کرتا ہے جو چارٹر سکولوں میں جدوجہد کر رہے ہیں، معطل یا چارٹر سکولوں سے اخراج کے خطرے میں ہیں، یا اپنی خصوصی تعلیمی خدمات حاصل کرنے میں ناکام ہیں۔